Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzrn3Q69ZS0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzrn3Q69ZS0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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