Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms