Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kiaa1549Q68FD9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kiaa1549Q68FD9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms