Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltcQ68FD5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms