Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef39Q66JY6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef39Q66JY6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms