Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb1Q64318 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms