Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pan3Q640Q5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pan3Q640Q5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms