Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PatjQ63ZW7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PatjQ63ZW7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PatjQ63ZW7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms