Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms