Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf260Q62513 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf260Q62513 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms