Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn4Q62472 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms