Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga3Q62470 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms