Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CcncQ62447 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CcncQ62447 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms