Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3gl2Q62420 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3gl2Q62420 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms