Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim28Q62318 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim28Q62318 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms