Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall3Q62255 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall3Q62255 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms