Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5aQ62217 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema5aQ62217 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms