Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sycp1Q62209 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sycp1Q62209 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms