Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttf1Q62187 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms