Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3cQ62181 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms