Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprrQ62132 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprrQ62132 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms