Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prm3Q62100 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms