Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtafrQ62035 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms