Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctr9Q62018 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctr9Q62018 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms