Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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