Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itga7Q61738 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms