Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms