Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gli3Q61602 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms