Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msi1Q61474 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms