Protein–RNA interactions for Protein: Q61418

Clcn4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn4Q61418 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clcn4Q61418 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcn4Q61418 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms