Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3c2aQ61194 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3c2aQ61194 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms