Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lamb3Q61087 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lamb3Q61087 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms