Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TmpoQ61033 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TmpoQ61033 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms