Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf4Q60793 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf4Q60793 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms