Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Foxd4Q60688 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms