Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmtk3Q5XJV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmtk3Q5XJV6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmtk3Q5XJV6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms