Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms