Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Myh1Q5SX40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myh1Q5SX40 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms