Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf12Q5SPL2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms