Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc85aQ5SP85 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85aQ5SP85 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms