Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rtp3Q5QGU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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