Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms