Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms