Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GpkowQ56A08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GpkowQ56A08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms