Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shank3Q4ACU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shank3Q4ACU6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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