Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam220aQ3ZN08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam220aQ3ZN08 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam220aQ3ZN08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam220aQ3ZN08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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