Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc110Q3V125 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms