Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms