Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Garnl3Q3V0G7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms