Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9Q3V038 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms